Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CAPSQ13938 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms