Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TDGQ13569 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TDGQ13569 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TDGQ13569 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TDGQ13569 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms