Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CAMK2DQ13557 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CAMK2DQ13557 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms