Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SMAD4Q13485 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAD4Q13485 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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