Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PTPRSQ13332 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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PTPRSQ13332 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PTPRSQ13332 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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