Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CHAF1AQ13111 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1AQ13111 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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