Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CSTF3Q12996 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CSTF3Q12996 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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