Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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NPRL3Q12980 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NPRL3Q12980 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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