Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTP4A2Q12974 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms