Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NFIAQ12857 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms