Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FMODQ06828 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FMODQ06828 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FMODQ06828 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms