Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTPN11Q06124 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms