Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GBE1Q04446 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms