Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms