Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CDC42EP1Q00587 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms