Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDK6Q00534 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms