Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GTF2BQ00403 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GTF2BQ00403 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms