Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAT1AQ00266 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAT1AQ00266 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms