Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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H3F3AP84243 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H3F3AP84243 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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