Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SIM1P81133 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SIM1P81133 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms