Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
HBBP68871 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
HBBP68871 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
HBBP68871 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HBBP68871 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms