Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNRPNP63162 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms