Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DCDC1P59894 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms