Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NUP107P57740 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NUP107P57740 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NUP107P57740 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms