Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BACE1P56817 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BACE1P56817 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms