Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SH3BGRP55822 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms