Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CASP9P55211 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CASP9P55211 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP9P55211 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms