Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD23AP54725 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms