Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ACTG1P22-201ENST00000603793 1099 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 METTL15-210ENST00000634721 1182 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATN1P54259 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATN1P54259 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms