Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms