Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TSFMP43897 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TSFMP43897 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms