Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CASP2P42575 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CASP2P42575 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms