Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RORAP35398 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RORAP35398 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RORAP35398 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RORAP35398 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms