Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SFNP31947 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SFNP31947 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SFNP31947 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms