Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA6P31267 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms