Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ALDH4A1P30038 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms