Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CRABP1P29762 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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