Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF2E1P29083 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms