Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HTR1BP28222 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms