Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
HLA-DMAP28067 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms