Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTPRDP23468 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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