Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPS6KB1P23443 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms