Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ITGA6P23229 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGA6P23229 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms