Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
POLR2CP19387 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms