Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PTPRAP18433 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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PTPRAP18433 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PTPRAP18433 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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