Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPCAMP16422 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPCAMP16422 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms