Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
HOXB3P14651 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC063950.1-202ENST00000600133 568 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HOXB3P14651 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms