Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CEACAM1P13688 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CEACAM1P13688 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms