Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ODC1P11926 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ODC1P11926 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms