Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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SFTPCP11686 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SFTPCP11686 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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